Bioinformatika: Béda antara owahan

Konten dihapus Konten ditambahkan
Top4Bot (parembugan | pasumbang)
ganti isi, replaced: arupa → wujud (3)
Top4Bot (parembugan | pasumbang)
c ndandani pangéja, replaced: Amérika Sarékat → Amérikah Sarékat (5) using AWB
Larik 6:
Istilah ''bioinformatics'' wiwit diwedharaké ing tengah éra [[1980]]-an kanggo ngacu panrapan [[komputer]] ing biologi. Éwadéné mangkono, panrapan babagan-babagan ing bioinformatika (kaya panggawéan basis data lan pangembangan [[algoritma]] kanggo analisis [[sekuens biologis]]) wis dilakokaké wiwit taun [[1960]]-an.
 
Kamajuan tèhnik [[biologi molekular]] kanggo ndungkap sekuens biologis saka [[protéin]] (wiwit awal [[1950]]-an) lan [[asem nukleat]] (wiwit 1960-an) miwiti mekaring basis data lan tèhnik analisis sekuens biologis. Basis data sekuens protéin wiwit dikembangaké taun [[1960]]-an ing [[AmérikaAmérikah Sarékat]], sauntara basis data sekuens DNA dikembangaké akir [[1970]]-an ing AmérikaAmérikah Sarékat lan [[Jerman]] (ing ''European Molecular Biology Laboratory'', Laboratorium Biologi Molekular [[Éropah]]). Panemon tèhnik [[sekuensing]] DNA kang luwih rikat ing tengah taun [[1970]]-an dadi landhesan dumadiné ledakan cacahé sekuens DNA kang kasil didungkapaké ing taun [[1980]]-an lan [[1990]]-an, dadi salah sawijining pambuka dalan kanggo proyèk-proyèk pandungkapan [[genom]], ngundhakaké kabutuhan marang panglolaan lan analisis sekuens, lan pungkasané njalari lairé bioinformatika.
 
Mekaré [[internet|internèt]] uga njurung mekaré bioinformatika. Basis data bioinformatika kang gumandhéng liwat internèt nggampangaké èlmuwan nglumpukaké asil sekuensing nuju basis data mau uga olèh sekuens biologis minangka bahan analisis. Saliyané iku, panyebaran [[program]]-program aplikasi bioinformatika liwat internèt nggampangaké èlmuwan ngakses program-program mau lan banjur nggampangaké pangembangané.
Larik 14:
Selaras kaliyan jinis informasi biologis kang disimpen, [[basis data]] sekuens biologis bisa wujud basis data primer kanggo nyimpen sekuens primer [[asem nukleat]] utawa [[protéin]], basis data sékundhèr kanggo nyimpen motif sekuens [[protéin]], lan basis data struktur kanggo nyimpen data struktur protéin utawa asem nukleat.
 
Basis data utama kanggo sekuens [[asem nukleat]] saiki ya iku [http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Genbank/index.html GenBank] (AmérikaAmérikah Sarékat), [http://www.ebi.ac.uk/embl/ EMBL] (Éropah), lan [http://www.ddbj.nig.ac.jp/ DDBJ] (''DNA Data Bank of Japan'', [[Jepang]]). Katelu basis data mau makarya bebarengan lan ijol-ijolan data saben dina kanggo njaga kawiyaran cakupan saben basis data. Sumber utama data sekuens asem nukleat ya iku submisi langsung saka periset individual, proyèk sekuensing [[genom]], lan pandaftaran [[paten]]. Isi saliyané sekuens asem nukleat, entri ing basis data sekuens asem nukleat lumrahé ngandhut informasi ngenani jinis asem nukleat ([[DNA]] utawa [[RNA]]), jeneng [[organisme]] sumber asem nukleat mau, lan pustaka kang ana kaitané karo sekuens asem nukleat mau.
 
Sauntara iku, conto sapérangan basis data wigati kang nyimpen sekuens primer protéin ya iku [http://pir.georgetown.edu/home.shtml PIR] (''Protein Information Resource'', AmérikaAmérikah Sarékat), [http://au.expasy.org/sprot/ Swiss-Prot] (Éropah), lan [http://www.ebi.ac.uk/trembl/ TrEMBL] (Éropah). Katelu basis data mau wis digabungaké ing [http://www.ebi.uniprot.org/index.shtml UniProt] (kang dana mligi saka AmérikaAmérikah Sarékat). Entri ing UniProt ngandhut informasi ngenani sekuens protéin, jeneng organisme sumber protéin, pustaka kang ana kaitané, lan komentar kang lumrahé isiné panjlasan ngenani fungsi protéin mau.
 
[http://www.ncbi.nlm.nih.gov/BLAST/ '''BLAST'''] (''Basic Local Alignment Search Tool'') wujud perkakas bioinformatika kang gumandhéng raket karo panggunaan basis data sekuens biologis. Panlusuran BLAST (''BLAST search'') ing basis data sekuens mungelaké èlmuwan kanggo nggolèki sekuens asem nukleat uga protéin kang mèmper karo sekuens tinentu kang diduwèni. Bab iki migunani umpamané kanggo nemu [[gen]] sajenis ing sapérangan [[organisme]] utawa kanggo mriksa kaabsahan asil [[sekuensing]] uga kanggo mriksa fungsi gen asil sekuensing. [[Algoritma]] kang ndhasari makarya BLAST ya iku panyejajaran sekuens.